必要に迫られて作ったモノですがいい感じなので公開します。FreeStyleWiki 3.6.3 と 複数ファイル添付を可能にするプラグイン _ex_attach (20090610) が前提です（これ以前のバージョンでは動きません）。

• パッチはこちら: fswiki-decompress-ex_atach.r3.patch
• UTF-8 パッチを当てている方はこちら: fswiki-decompress-ex_atach-utf8.r3.patch

ライセンスは GPL version 2 or (at your opinion) any later version です。

パッチを当てると、「添付ファイルを ZIP で圧縮してまとめてダウンロードする機能」と「ZIP 圧縮したファイルをアップロードした場合、その内容を展開して添付する機能」（アップロード時に「圧縮ファイルを解凍して添付」にチェックした場合。それ以外の場合は ZIP ファイルがそのままアップロードされる）の 2 点が追加されます。Archive::Zip を使用しているため、入っていない環境では yum -y install perl-Archive-Zip や cpan などで適宜インストールしてください。また、生じうるセキュリティリスクを認識して使用してください。

需要はあんまり無さそうですが、せっかく書いたパッチが紛失すると悲しいのでここに添付しておきます :-)
気が向いたら .tar.gz とかにも対応するかもしれない。

(追記) 3.6.4 でも動作を確認しました。

(追記 2016/04/17) EUC-JP 版に Jun Futagawa さんに頂いたパッチを反映しました（コメント参照）。旧版はこちら。 fswiki-decompress-ex_atach.patch
(追記 2023/10/21) "Can't use 'defined(@array)' (Maybe you should just omit the defined()?)" に対処しました。旧版はこちら。 fswiki-decompress-ex_atach.r2.patch, fswiki-decompress-ex_atach-utf8.patch