OpenLDAP の DB_CONFIG は良く分からないで使わない方がいいかも の件について、いくつか補足を。

o __db.00* ファイルの実態は sparse file なので、ls -l などで表示したファイルサイズが大きく見えても、du などで表示させてみると意外と小さかった、ということがあり得ます。
o set_flags DB_LOG_AUTOREMOVE と指定しても、あまり容量は変わらないようです。

どの程度チューニングすればパフォーマンスが最適になるのか微妙なところで、良く分かりません（ま、素人に分からないからこそデータベース屋さんというのが居るのでしょう...）。